Desde 2002, Panacetacea ha estado realizando estudios de mamíferos marinos en el Golfo de Chiriquí. Nuestro objetivo principal es monitorear dos poblaciones diferentes de ballenas jorobadas que usan Chiriquí como área de invernada: una que migra desde áreas de alimentación frente a la Antártida y Chile y se observa entre julio y octubre, y otra que migra desde áreas de alimentación frente a la costa oeste de los EE. UU. y se ven entre diciembre y abril. Documentamos el uso del hábitat, los comportamientos, tomamos fotos de identificación, grabamos canciones y recolectamos muestras de biopsias. También hemos documentado otras especies de mamíferos marinos, incluidas las ballenas de Bryde y cuatro especies de odontocetos.

Desde el 2004 hemos estado trabajando en Bocas del Toro estudiando la ecología, el comportamiento y la genética de una población residente de delfines nariz de botella. También estudiamos el impacto potencial de las actividades humanas sobre los animales y su hábitat. Nuestro trabajo ha demostrado que los delfines de Bocas se ven afectados negativamente por las interacciones directas con los barcos turísticos. Nuestros informes a la Comisión Ballenera Internacional y al Gobierno de Panamá han ayudado a los funcionarios del gobierno a ser más conscientes de la situación.

La iniciativa ONDAS es una red de vigilancia acústica submarina remota que registra el paisaje sonoro de varias comunidades marinas. Los datos recopilados a través de esta iniciativa pueden generar medidas acústicas de biodiversidad, abundancia de especies emblemáticas y niveles de ruido ambiental, como indicadores de la salud de la comunidad.
El objetivo de esta iniciativa es proporcionar a las partes interesadas en América Central las herramientas y la información para evaluar la eficacia de las Áreas Marinas Protegidas. La iniciativa tiene como objetivo facilitar las decisiones oportunas sobre la planificación de la conservación mediante la promoción de la conectividad y la investigación. Esto nos permitirá evaluar mejor el valor económico de estas áreas y aumentar la conciencia sobre la conservación marina en la región.